历经千年的传承，中药的有效性、实用性和科学性已毋庸置疑，但是其多成分、多靶点、多层次的作用特点给作用机制的研究带来困难，阻碍了中药的现代化和国际化进程。蛋白质组学技术是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质的组成与活动规律，与中药的“整体观”和“动态观”不谋而合，为阐明中药作用机制带来了曙光。
近年，蛋白质组学技术在中药作用机制和药物靶点研究（>>>中药靶点研究攻略：一文精通中药靶点研究思路）中的应用取得了实质性的进展。本期，我们将探讨蛋白质组学如何助力中药研究，深入理解其在中药作用机制中的关键角色。让我们一探究竟，掌握中药作用机制研究的新思路！
2024年8月，广州中医药大学第一附属医院黄秀芳团队在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上发表了题为“Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma”的研究论文，该研究以中性粒细胞性哮喘组小鼠为研究对象，平行设置对照组、地塞米松治疗组、低/中/高剂量小青龙汤（XQLD）治疗组，利用网络药理学、TMT定量蛋白质组学和动物实验等发现XQLD通过抑制铁死亡途径和ARG1、MMP12、SPP1表达，以及激活Rap1信号通路，有效改善了嗜中性粒细胞性哮喘小鼠的气道炎症。
TMT定量蛋白质组学揭示小青龙汤对中性粒细胞性哮喘的保护作用[1]
2024年5月，贵州中医药大学钱海兵团队在期刊Front Pharmacol (IF= 4.4)上发表了题为“Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics”的研究论文，该研究以高血压大鼠为研究对象，平行设置对照组、模型组、阴性对照组和低/中/高剂量土茯苓（SGR）治疗组，利用TMT定量蛋白质组学、药物成分鉴定、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析和分子对接发现SGR通过调节ALDH2等核心靶标，可能影响多种免疫细胞的浸润，从而对高血压产生治疗作用。
TMT定量蛋白质组学揭示土茯苓治疗高血压的分子机制[2]
2024年5月，福建医科大学李少光团队在期刊Phytomedicine (IF=6.7)上发表了题为“Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia”的研究论文，该研究以心肌缺血小鼠为研究对象，平行设置对照组、模型组和人参皂苷（Re）治疗组，利用药效学研究、网络药理学、分子对接和TMT定量蛋白质组学发现人参皂苷Re可能通过靶向MAPK、AKT、AMPK和铁死亡途径来预防和/或治疗心肌缺血损伤，并保护心肌细胞免受氧化损伤。
TMT定量蛋白质组学揭示人参皂苷Re抗心肌缺血的潜在靶标[3]
2024年5月，南京中医药大学附属中西医结合医院朱粉霞团队在期刊J Ethnopharmacol (IF= 4.8)上发表了题为“Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques”的研究论文，该研究以格雷夫斯病（GD）小鼠为研究对象，平行设置模型组、低/高剂量消瘿汤治疗组和GPS（龙胆苦苷）治疗组，利用药效学研究、药物成分鉴定、TMT定量蛋白质组学和分子对接等发现GPS是XHXY治疗GD的主要有效物质基础，XHXY通过促进甲状腺细胞凋亡发挥治疗GD的疗效，这一过程涉及到上调FADD、Caspase 8和Caspase 3的表达。TMT定量蛋白质组学揭示消瘿汤治疗格雷夫斯病的机制
TMT定量蛋白质组学揭示消瘿汤治疗格雷夫斯病的机制[4]
2024年1月，广州中医药大学张晓君团队在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上发表了题为“Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics”的研究论文，该研究以肺癌小鼠为研究对象，平行设置对照组以及益气除痰方（YQCTF-AE）治疗组，利用网络药理学、药物成分鉴定、药效学研究和4D定量蛋白质组学发现YQCTF抑制了小鼠NSCLC异种移植物的进展，抑制了促肿瘤的肿瘤相关中性粒细胞，并改善了肿瘤免疫微环境（TIME）。4D定量蛋白质组学揭示益气除痰方抑制肺癌的机制
4D定量蛋白质组学揭示益气除痰方抑制肺癌的机制[5]
中药作用机制的研究是药物开发和生命科学领域的热点话题，对于中药现代化至关重要。本文分享了中药研究的新策略，强调了蛋白质组学在其中的关键作用。通过比较中药处理前后的蛋白质组学变化，我们能够发现潜在的治疗靶点和信号通路，为中药的现代化进程注入新动力。让我们一起探索这一领域的最新进展，推动中药研究向前发展！蛋白质组学在中药作用机制研究中的思路
蛋白质组学在中药作用机制研究中的思路
【参考文献】 [1] Liao G, Yan Q, Zhang M, et al. Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 330. [2] Yang X, Qian H, Yang C, et al. Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics [J]. Frontiers in Pharmacology, 2024, 15. [3] Cai J, Zhan Y, Huang K, et al. Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia [J]. Phytomedicine, 2024, 132. [4] Xiang P, Li Q, Cui G, et al. Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 324. [5] Le-Xin C, Ming-Jun L, Chun-Qi X, et al. Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 318.
